經顱多普勒超聲檢查一般不會很痛苦，因為其是利用超聲多普勒技術完成對顱內外血管的檢查，是無創的檢查方式，且較為安全。但部分患者可能會產生一定的不適感，主要與患者的敏感性、配合程度、檢查時的環境等因素有關。

1、敏感性：部分患者對疼痛比較敏感，由于在進行經顱多普勒超聲檢查時，需要將管球在顱骨窗口處通過，患者可能會感到一定的不適感，一般可以忍受，不會特別痛苦;

2、配合程度：如果患者在檢查時不能較好地配合醫生進行活動，可能會出現頭皮發麻、發脹的感覺。如果不能完全配合醫生進行活動，可能會導致檢查的效果不佳，此時痛苦可能會比較大。但一般也都可以進行忍受，或者在醫生的指導下通過轉移注意力、放松心情等方式來進行緩解;

3、檢查時的環境：如果患者在檢查時處于嘈雜的環境中，可能會感到不適，也會產生痛苦感。建議在檢查時選擇安靜、舒適的環境，從而可以減少不適感;

4、其他：如果患者比較緊張，害怕有創性操作，也可能會比較痛苦。此時可以在醫生指導下適當放松心情，從而減少痛苦。

經顱多普勒超聲除了可以應用于血管疾病的診斷，還可以用于評估腦外傷的情況，有較多的優點。但由于部分患者耐受性較差，所以在做經顱多普勒超聲時，應根據醫生的建議選擇合適的檢查方式。