超聲內鏡是指在消化道內鏡檢查中，應用內鏡加超聲的共同技術，對消化道內部病變進行直觀、微創的檢查手段。主要目的在于明確診斷，篩查疾病，并進行治療監測。

1、明確診斷：超聲內鏡可以經口腔進入，也可以經肛門處進入，可以明確胃腸道病變的位置、大小、形態、表面光滑度、有無潰瘍、腫瘤以及出血等。通過超聲內鏡可以觀察到病變的具體情況，比如隆起、息肉、潰瘍的位置、大小、形態、表面是否光滑，以及邊界是否清晰等，從而明確病變的性質;

2、篩查疾病：比如胃鏡不能明確的診斷胃癌，超聲內鏡可以對胃癌進行初步篩查，如果發現胃黏膜有隆起或者黏膜潰瘍，還可以通過超聲內鏡引導下的病理檢查，進一步明確診斷。此外，超聲內鏡也可以對胃腸道息肉進行初步診斷，如果發現息肉超聲內鏡可疑或者無法確認，還可以通過超聲內鏡下的電凝止血、黏膜切除術等，進行息肉的治療;

3、治療監測：超聲內鏡對早期胃癌和腸癌的治療具有重要的意義，可以通過超聲內鏡引導下的穿刺活檢做病理檢查，進一步明確診斷，觀察治療效果，以及判斷有無復發等。

此外，超聲內鏡也有其它的作用，比如超聲內鏡引導下的放射性核素掃描，可用于胰腺癌和肝癌的診斷、鑒別診斷。超聲內鏡技術逐漸發展，臨床上也可以應用于食管、甲狀腺、頸部血管疾病的診斷。